Cours Unix de la remise en forme du DEA Analyse numérique

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Depuis 2005 avec l'arrivée des Pentium D (Smithfield = 2 Pentium 4 Prescott), les processeurs d'architecture x86 disposent aujourd'hui pour la plupart de plusieurs coeurs de calcul.En réalisant l'exécution du code sur plusieurs processeurs ou plusieurs coeurs on diminue généralement le temps de calcul, il faut pour cela paralléliser nos algorithmes. La plupart des commandes présentées ici sont documentées dans votre système. Il vous suffit de taper dans une console man suivi d'un espace et du nom de la commande pour avoir toutes les informations sur le fonctionnement de la commande voulue. Pour plus d'informations à ce sujet, reportez-vous à la page « Le manuel ». Lancer des jobs avec qsub qsub ... Parfois, des binaires sont disponibles en téléchargement pour votre logiciel. Dans ce cas, ... module load R-3.2.0 # l'option "-V" peut aussi être rajoutée à la liste des options SGE dans le script de soumission ($# -V). Les options « -n » et « -R » informent le cluster des ressources utilisées par la commande, respectivement le nombre de CPU et la quantité de mémoire (en MB). La commande pourrait éventuellement fonctionner sans ces deux options, mais il s'agit ici d'informer le système pour éviter l'encombrement. Télécharger le document Créer des cartes mémoire S'identifier Les documents

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